Prescribir el mejor medicamento puede requerir ir con el intestino del paciente, o al menos, las bacterias que viven allí.

Informes anecdóticos han revelado que algunos microbios que viven en el intestino alteran químicamente los medicamentos orales, lo que afecta el funcionamiento de esos medicamentos (SN Online: 7/19/13).

Pero el alcance de este problema sigue sin estar claro. Ahora, un amplio estudio de estas interacciones sugiere que las bacterias intestinales pueden modificar muchos medicamentos y que la composición genética de la microbiota de un paciente puede predecir la respuesta de esa persona a los medicamentos, informan los investigadores en línea el 3 de junio en Nature.

“Saber cómo los microbios intestinales … afectan una droga es sumamente útil”, dice Matthew Redinbo, un bioquímico de la Universidad de Carolina del Norte en Chapel Hill. Un atlas de efectos microbianos en los medicamentos orales podría ayudar a las compañías farmacéuticas a desarrollar medicamentos más efectivos y ayudar a los médicos a adaptar mejor el tratamiento de un paciente.

Los investigadores probaron la capacidad de 76 tipos de bacterias, seleccionadas para representar la diversidad microbiana del intestino humano, para alterar la estructura molecular de 271 medicamentos orales, desde hormonas hasta medicamentos antivirales. Las bacterias se incubaron con nutrientes y soluciones farmacológicas en tubos de ensayo durante 12 horas. En ese tiempo, 176, o aproximadamente dos tercios, de los 271 medicamentos fueron modificados por al menos una cepa bacteriana, y cada cepa modificó de 11 a 95 medicamentos diferentes.

“Eso es enorme”, dice Nichole Klatt, un investigador en microbiomas de la Universidad de Miami que no participa en el trabajo. Pero saber qué microbios afectan qué medicamentos no es suficiente. Los estudios futuros podrían investigar exactamente cómo las bacterias modifican químicamente los medicamentos y las consecuencias dentro del cuerpo humano, dice ella.

Maria Zimmermann-Kogadeeva, una bióloga computacional de la Universidad de Yale, y sus colegas demostraron que la composición genética colectiva de la microbiota intestinal de un individuo puede predecir cómo responderá esa persona a un medicamento.

El equipo primero desarrolló una técnica para identificar qué parte del ADN de una bacteria le da la capacidad de modificar un medicamento en particular. Este paso involucró cortar el ADN de una bacteria de interés e insertar fragmentos individuales en las células de E. coli . El monitoreo de qué E. coli desarrolló la capacidad de alterar los medicamentos específicos expuestos y los fragmentos de ADN que se estaban mezclando con esos medicamentos.

Luego, en una serie de experimentos con diferentes medicamentos, los investigadores monitorearon las capacidades modificadoras de los medicamentos de toda la población microbiana en muestras fecales de 28 personas. En cada experimento, todas las comunidades microbianas fueron expuestas al mismo medicamento. Posteriormente, los investigadores buscaron en los microbios en cada muestra de heces los fragmentos de ADN alteradores del fármaco identificados en la prueba de E. coli , así como fragmentos de ADN de otros microbios que eran al menos un 50 por ciento similares. Se cree que tales segmentos de ADN similares tienen funciones similares.

La cantidad de estas piezas de ADN de apariencia similar en cada muestra fecal se alineó con la cantidad que la población microbiana modificó un determinado fármaco, encontró el equipo. Eso sugiere que las pruebas genéticas de la población de bacterias en la caca de un paciente podrían medir la probabilidad de que la microbiota de esa persona interfiera con ciertos medicamentos.

Esta información puede ayudar a los médicos a elegir los medicamentos, o decidir si prescribir un tratamiento para hacer que las bacterias intestinales de una persona sean más susceptibles a un determinado medicamento. “No se puede simplemente cambiar el hígado [de un paciente] porque alguien no metaboliza bien un medicamento”, dice el coautor del estudio Michael Zimmermann, científico farmacéutico y biólogo de sistemas en Yale. Pero los antibióticos o los trasplantes fecales pueden manipular estratégicamente la población microbiana de un paciente (SN Online: 5/18/18).

Por otro lado, la capacidad de los microbios para interferir con la forma en que el cuerpo procesa los medicamentos “en realidad puede ser beneficiosa”, dice Zimmermann-Kogadeeva. Además de diseñar píldoras para evitar ciertas reacciones adversas a las bacterias, las compañías farmacéuticas también podrían desarrollar medicamentos que exploten las modificaciones microbianas para mejorar o prolongar el efecto de un medicamento, dice ella

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